Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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NipblQ6KCD5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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NipblQ6KCD5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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