Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psme1P97371 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme1P97371 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms