Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms