Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms