Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CTF1Q16619 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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CTF1Q16619 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CTF1Q16619 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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CTF1Q16619 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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CTF1Q16619 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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CTF1Q16619 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
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CTF1Q16619 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CTF1Q16619 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CTF1Q16619 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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