Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

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Length 881 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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PKP2Q99959 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PKP2Q99959 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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PKP2Q99959 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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PKP2Q99959 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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PKP2Q99959 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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PKP2Q99959 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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