Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NRF1Q16656 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
NRF1Q16656 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NRF1Q16656 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NRF1Q16656 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms