Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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TNFAIP1Q13829 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TNFAIP1Q13829 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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TNFAIP1Q13829 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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TNFAIP1Q13829 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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TNFAIP1Q13829 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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TNFAIP1Q13829 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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TNFAIP1Q13829 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNFAIP1Q13829 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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