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Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1
FAM3D, Protein FAM3D, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
FAM3D
Q96BQ1
FGF7P7-201
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□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-881P-201
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102 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
AL513043.2-201
ENST00000573941
143 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR5704-201
ENST00000584029
77 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
AL035470.1-201
ENST00000622571
220 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP457-201
ENST00000363657
124 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-426P-201
ENST00000516464
97 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR4679-2-201
ENST00000578358
77 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR3613-201
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87 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNY3P2-201
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102 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.118-201
ENST00000363300
101 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.346-201
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112 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-132P-201
ENST00000383863
107 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.549-201
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102 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
AC008883.1-201
ENST00000506562
193 nt
TSL 3
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.659-201
ENST00000515994
113 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MTND5P41-201
ENST00000517498
206 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU4-36P-201
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144 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNY1P7-201
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110 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR518B-201
ENST00000385127
83 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-772P-201
ENST00000516042
105 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR6759-201
ENST00000638110
65 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1184P-201
ENST00000384588
108 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-721P-201
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105 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MTND4LP9-201
ENST00000427694
174 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR3179-1-201
ENST00000578940
84 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR3179-2-201
ENST00000579107
84 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR3179-3-201
ENST00000579566
84 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR6773-201
ENST00000612812
74 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR3179-4-201
ENST00000617599
84 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
SNORA63.2-201
ENST00000362603
126 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.257-201
ENST00000364596
102 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.484-201
ENST00000384389
103 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.488-201
ENST00000384403
102 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
SNORD83B-201
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93 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP285-201
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119 nt
BASIC
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□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR4439-201
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80 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
AL353621.2-201
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133 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
MIR6854-201
ENST00000614935
69 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-495P-201
ENST00000362995
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
FAM3D
Q96BQ1
SNORA63.6-201
ENST00000364921
119 nt
BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
TRAJ57-201
ENST00000390482
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.57
FAM3D
Q96BQ1
IL6ST-207
ENST00000396816
168 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
FAM3D
Q96BQ1
SNORD22.1-201
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
AC068339.1-201
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
MIR3064-201
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FAM3D
Q96BQ1
MIR3140-201
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FAM3D
Q96BQ1
MIR8068-201
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FAM3D
Q96BQ1
AL157777.2-201
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FAM3D
Q96BQ1
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Q96BQ1
SNORD114-25-201
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FAM3D
Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
MIR548U-201
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-644P-201
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-1
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-337P-201
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-182P-201
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FAM3D
Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-813P-201
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FAM3D
Q96BQ1
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
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BASIC
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1250P-201
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FAM3D
Q96BQ1
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BASIC
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Q96BQ1
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BASIC
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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FAM3D
Q96BQ1
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BASIC
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Q96BQ1
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Q96BQ1
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107 nt
BASIC
-1.05
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FAM3D
Q96BQ1
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BASIC
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Q96BQ1
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ENST00000447704
118 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
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