Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RABGEF1Q9UJ41 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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