Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NKX1-1Q15270 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NKX1-1Q15270 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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