Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DDB1Q16531 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms