Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HDAC1Q13547 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HDAC1Q13547 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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