Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD12P35452 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD12P35452 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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