Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP17L12C9JPN9 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP17L12C9JPN9 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USP17L12C9JPN9 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP17L12C9JPN9 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
USP17L12C9JPN9 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
USP17L12C9JPN9 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP17L12C9JPN9 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP17L12C9JPN9 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP17L12C9JPN9 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
USP17L12C9JPN9 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.2 ms