Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF548Q8NEK5 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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