Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DSC3Q14574 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DSC3Q14574 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.3 ms