Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NR1D1P20393 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
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NR1D1P20393 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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NR1D1P20393 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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NR1D1P20393 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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NR1D1P20393 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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NR1D1P20393 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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NR1D1P20393 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NR1D1P20393 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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