Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
VPREB1P12018 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
VPREB1P12018 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.8 ms