Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FSCN1Q16658 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FSCN1Q16658 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FSCN1Q16658 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms