Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.4 ms