Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CBX3Q13185 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CBX3Q13185 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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CBX3Q13185 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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CBX3Q13185 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CBX3Q13185 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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