Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRAP18433 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRAP18433 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRAP18433 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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