Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SURF1Q15526 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SURF1Q15526 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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SURF1Q15526 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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SURF1Q15526 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SURF1Q15526 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SURF1Q15526 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SURF1Q15526 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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