Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTF1Q15361 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTF1Q15361 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.9 ms