Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
DDX39BQ13838 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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DDX39BQ13838 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX39BQ13838 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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