Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRBP23467 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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PTPRBP23467 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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PTPRBP23467 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRBP23467 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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