Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MylkQ6PDN3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MylkQ6PDN3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms