Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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