Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms