Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PHF3Q92576 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
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