Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF20Q5VTR2 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RNF20Q5VTR2 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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