Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
KARSQ15046 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KARSQ15046 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KARSQ15046 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KARSQ15046 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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