Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PLS1Q14651 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PLS1Q14651 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.2 ms