Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB40BQ12829 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB40BQ12829 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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