Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
FOXD4Q12950 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXD4Q12950 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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