Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPN13Q12923 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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