Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SQSTM1Q13501 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SQSTM1Q13501 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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