Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt71Q9R0H5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms