Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Edf1Q9JMG1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Edf1Q9JMG1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.2 ms