Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb3P09026 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb3P09026 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms