Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx7F8VPJ6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx7F8VPJ6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms