Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SGCAQ16586 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SGCAQ16586 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.7 ms