Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
DDB1Q16531 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms