Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZIC1Q15915 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZIC1Q15915 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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