Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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