Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
DDX39BQ13838 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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