Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXD4Q12950 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXD4Q12950 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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