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Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4
BBS9, Protein PTHB1, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
BBS9
Q3SYG4
PIK3C2G-202
ENST00000433979
4840 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
snoU2-30.2-201
ENST00000362805
70 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNY1P11-201
ENST00000363759
113 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1325P-201
ENST00000364905
105 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.563-201
ENST00000384707
108 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP467-201
ENST00000391274
118 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
SNORA26-201
ENST00000391286
122 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
AL590004.2-201
ENST00000404787
371 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
SNORD88.1-201
ENST00000408684
91 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1146P-201
ENST00000516282
102 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNU6-126P-201
ENST00000516685
103 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
AC011604.1-201
ENST00000545978
196 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
AC090049.2-201
ENST00000550377
109 nt
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
LINC02277-202
ENST00000556472
453 nt
TSL 3
BASIC
2.93
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
SNORD115-3-201
ENST00000363100
82 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
SNORA9.2-201
ENST00000365361
133 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1056P-201
ENST00000383996
107 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.621-201
ENST00000411065
96 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
CYCSP49-201
ENST00000420810
319 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
AL353743.2-204
ENST00000456242
419 nt
TSL 3
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
SNORD11-201
ENST00000459124
84 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
SNORA70.24-201
ENST00000517233
118 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
AC024610.1-201
ENST00000582685
323 nt
TSL 3
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
MIR4325-201
ENST00000583049
90 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
AC097639.2-201
ENST00000603159
172 nt
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
CCSAP-202
ENST00000366686
4399 nt
TSL 2
BASIC
2.92
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.111-201
ENST00000363248
100 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
MIR520G-201
ENST00000385064
90 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
AL355388.1-201
ENST00000415726
401 nt
TSL 2
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
EDDM3CP-201
ENST00000415977
425 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1096P-201
ENST00000517089
102 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RN7SKP57-201
ENST00000517248
293 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
NDUFA5P6-201
ENST00000542110
379 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
MIR4662B-201
ENST00000579498
81 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
JPX_2.1-201
ENST00000614161
69 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
PRKACB-207
ENST00000394838
4294 nt
TSL 5
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
MAPK10-266
ENST00000641066
6555 nt
BASIC
2.91
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
ZNF334-205
ENST00000615481
3706 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
2.9
□□□□□ -1.94
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP374-201
ENST00000362939
125 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.99-201
ENST00000363138
105 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
SNORA33-201
ENST00000363664
130 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.796-201
ENST00000364268
102 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.799-201
ENST00000364992
102 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU6-44P-201
ENST00000384045
107 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
SNORA9-201
ENST00000384215
133 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU6-851P-201
ENST00000384565
107 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU6-160P-201
ENST00000384591
107 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU11-5P-201
ENST00000391216
129 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
SNORA11.1-201
ENST00000408133
129 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
UBE2Q2P12-201
ENST00000414573
204 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RPL23AP83-201
ENST00000434984
473 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
YWHAEP4-201
ENST00000505390
198 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNA5SP76-201
ENST00000516277
87 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
NPPA-AS1_3.1-201
ENST00000617059
108 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
MIR6733-201
ENST00000635723
61 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
MIR338-201
ENST00000636369
67 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC009487.2-201
ENST00000420969
6821 nt
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
NOC3L-201
ENST00000371361
3455 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
SKIL-202
ENST00000413427
2702 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
OR4K2-204
ENST00000641885
8681 nt
APPRIS P1
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
SIRT1-202
ENST00000403579
3333 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.9
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
KBTBD3-207
ENST00000534815
3396 nt
TSL 5
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
SCN1A-219
ENST00000641575
12874 nt
APPRIS ALT1
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
CXADR-202
ENST00000356275
270 nt
TSL 1 (best)
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.120-201
ENST00000363304
110 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1209P-201
ENST00000363655
107 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.634-201
ENST00000364811
113 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1336P-201
ENST00000383886
109 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
MIR491-201
ENST00000384877
84 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
MIR562-201
ENST00000384894
95 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC022018.1-201
ENST00000430685
241 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RPS15AP28-201
ENST00000435088
386 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC233266.1-201
ENST00000454518
96 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
LINC01203-202
ENST00000456091
476 nt
TSL 3
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU7-107P-201
ENST00000459121
61 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
SCGB1D5P-201
ENST00000515134
247 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.692-201
ENST00000516627
105 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RPPH1-2P-201
ENST00000516688
293 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.712-201
ENST00000517011
92 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC007229.1-201
ENST00000590455
412 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC242852.1-201
ENST00000612151
96 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC022202.1-201
ENST00000613515
211 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
U4atac.1-201
ENST00000618345
95 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
NPPA-AS1_2.1-201
ENST00000618496
149 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC244015.1-201
ENST00000622301
99 nt
BASIC
2.89
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC096644.4-201
ENST00000563417
2912 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.91-201
ENST00000363042
107 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU1-96P-201
ENST00000364163
162 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
Y_RNA.333-201
ENST00000365274
102 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1138P-201
ENST00000365359
106 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
ATP5J2P3-201
ENST00000451550
258 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
ITCH-AS1-201
ENST00000454205
299 nt
TSL 5
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU7-26P-201
ENST00000458980
63 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC003982.1-202
ENST00000469928
248 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
OR9P1P-201
ENST00000496431
281 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RNU6-1291P-201
ENST00000516591
104 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC009930.1-201
ENST00000522330
191 nt
TSL 5
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
AC131055.1-201
ENST00000584626
316 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
RPL12P50-201
ENST00000603116
116 nt
BASIC
2.88
□□□□□ -1.95
BBS9
Q3SYG4
KTN1-203
ENST00000395309
4021 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
2.87
□□□□□ -1.95
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