Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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TRAF3Q13114 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
TRAF3Q13114 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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